Namun di tengah jalan, pembangunan sempat terhenti. Pembangunan sendiri bahkan mangkrak atau tersendat selama kurang lebih 10 tahun karena terkendala pengadaan lahan.
Adapun rinciannya adalah pada 17 Oktober 2005 diputuskan pemenang lelang Tol Desari. Kemudian pada 29 Mei 2006 dilakukan Penandatangan Perjanjian Pengusahanya Jalan Tol (PPJT).
Kemudian pada tahun 2010, terjadi evaluasi penerusan pengusahaan jalan Tol Desari. Kemudian pada Juni 2011 dilakukan Testament perjanjian pengusahaan jalan tol Desari.
Baca Juga: Tol Desari Jadi Alternatif Menuju Bogor
Pada 12 Agustus 2016, dibuat surat Perintah oleh Presiden Joko Widodo agar pengerjaan jalan tol Desari seksi 1 mulai dikerjakan. Kemudian pada 27 September 2018 jalan tol Desari Seksi I resmi beroperasi setelah diresmikan oleh Presiden Joko Widodo.
Sebagai informasi, Pembangunan Tol Desari terbagi dalam tiga seksi yaitu, seksi I ruas Antasari Brigif/Cinere sepanjang 5,80 Km seksi II ruas Brigif Sawangan sepanjang 6,30 Kr dan seksi li Sawangan - Bojong Gede, Bogor sepanjang 9,5 Km Total panjang keseluruhan ruas tol Depok Antasari yaitu 21,60 Km.