1. Keterbatasan suplai air baku,
2. Wilayah IKN dan sekitarnya merupakan habitat dan ruang jelajah beberapa spesies kunci seperti Orangutan, Bekantan, Beruang Madu, Pesut dan Dugong.
3. Terdapat 109 lubang tambang yang memerlukan penanganan lebih lanjut, dan
4. Kalimantan Timur memiliki ecological footprint tinggi di Kalimantan.