Kelas 1 memiliki biaya total Rp7.355.00, lalu kelas 2 memiliki biaya total Rp7.356.000, sedangkan tingkatan ketiga yakni dengan biaya total Rp8.098.000, lalu pada kelas 4 punya biaya total Rp7.925.000 serta kelas 5 yakni iaya total Rp7.945.000, kelas 6 yakni biaya total Rp8.387.000.
Seperti diketahui, Ponpes Al Zaytun disebut sebagai pesantren terbesar se-Asia Tenggara ("the largest Islamic madrasah in Southeast Asia").
Ponpes ini berdiri di atas lahan seluas 1.200 hektare. Pada 2011 saja, tercatat ada sekitar 7.000 santri yang menimba ilmu di pesantren ini. Mereka tak hanya berasal dari dalam negeri. Namun, juga dari mancanegara, seperti Malaysia, Singapura, Timor Leste, dan Afrika Selatan.
Selain itu, Presiden RI ke-3 B.J. Habibie meresmikannya pada 27 Agustus 1999 pada pondok pesantren.
Ponpes yang memiliki landasan yaitu "Pesantren spirit but modern system" ini menggunakan kurikulum yang mengacu pada Kementerian Agama dan Kementerian Pendidikan dan Kebudayaan.